ในศตวรรษที่ 21 ความสามารถในการแข่งขันของประเทศมิได้พิจารณาจากความอุดมสมบูรณ์ของทรัพยากรธรรมชาติหรือแรงงานราคาต่ำอีกต่อไป หากแต่ขึ้นอยู่กับ คุณภาพของทุนมนุษย์ ความเข้มแข็งขององค์ความรู้ และศักยภาพด้านนวัตกรรม เป็นสำคัญ ภายใต้บริบทดังกล่าว ระบบอุดมศึกษาจึงมีบทบาทเป็น “กลไกหลักเชิงยุทธศาสตร์” ของประเทศในการผลิตและพัฒนากำลังคนขั้นสูง การสร้างองค์ความรู้ใหม่ และการเชื่อมโยงวิทยาศาสตร์ วิจัย และนวัตกรรมเข้าสู่การพัฒนาเศรษฐกิจและสังคมอย่างยั่งยืน
พระราชบัญญัติการอุดมศึกษา พ.ศ. 2562 และที่แก้ไขเพิ่มเติม (ฉบับที่ 2) พ.ศ. 2568 ได้กำหนดเจตนารมณ์สำคัญให้รัฐมีหน้าที่ส่งเสริมและสนับสนุนการพัฒนาระบบอุดมศึกษาอย่างเป็นระบบ มีคุณภาพ และสอดคล้องกับทิศทางการพัฒนาประเทศในระยะยาว โดยเฉพาะการยกระดับศักยภาพสถาบันอุดมศึกษา การพัฒนากำลังคนสมรรถนะสูง การลดความเหลื่อมล้ำทางการศึกษา และการสร้างความสามารถในการแข่งขันของประเทศในเวทีโลก อย่างไรก็ตาม แม้ประเทศไทยจะมีการจัดสรรงบประมาณด้านอุดมศึกษาและการวิจัยมาอย่างต่อเนื่อง แต่โครงสร้างงบประมาณภาครัฐในปัจจุบันยังมีข้อจำกัดด้านความยืดหยุ่น ความต่อเนื่อง และการมุ่งเน้นผลลัพธ์เชิงระบบ ส่งผลให้การลงทุนส่วนใหญ่เป็นไปในลักษณะระยะสั้นและกระจัดกระจาย ไม่สามารถรองรับภารกิจเชิงยุทธศาสตร์ที่ต้องการการลงทุนระยะยาวและการบริหารความเสี่ยงได้อย่างเพียงพอ หลักฐานเชิงประจักษ์จากองค์กรระหว่างประเทศจึงสะท้อนภาพที่น่ากังวลว่า ระบบอุดมศึกษาไทยยังมีช่องว่างด้านคุณภาพ ศักยภาพการแข่งขัน และความเชื่อมโยงกับเศรษฐกิจฐานความรู้ เมื่อเปรียบเทียบกับประเทศพัฒนาแล้วและประเทศคู่แข่งในภูมิภาค
ด้วยเหตุนี้ การจัดตั้ง “กองทุนเพื่อพัฒนาการอุดมศึกษา” จึงเป็นกลไกทางการเงินตามเจตนารมณ์ของกฎหมาย ที่มุ่งเสริมสร้างความสามารถของรัฐในการลงทุนเชิงยุทธศาสตร์ด้านอุดมศึกษาอย่างต่อเนื่องและมุ่งเน้นผลลัพธ์ เพื่อยกระดับระบบอุดมศึกษาไทยให้สามารถตอบสนองต่อความท้าทายของโลกยุคใหม่ สนับสนุนการพัฒนากำลังคนและองค์ความรู้ที่ประเทศจำเป็นต้องมี และวางรากฐานการพัฒนาประเทศอย่างมั่นคงและยั่งยืนในระยะยาว
กองทุนดำเนินงานภายใต้กรอบกฎหมายและการกำกับดูแลของคณะกรรมการที่มีผู้แทนหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง ทั้งด้านอุดมศึกษา วิทยาศาสตร์ วิจัยและนวัตกรรม และด้านการคลังของรัฐ โดยมีความคล่องตัวและความเป็นอิสระในระดับที่เหมาะสมในการบริหารจัดการทุน ยึดหลักธรรมาภิบาล ความโปร่งใส ตรวจสอบได้ และความรับผิดชอบต่อสังคม เพื่อสร้างความเชื่อมั่นให้แก่สำนักงบประมาณ หน่วยงานรัฐ และประชาชนผู้เป็นเจ้าของภาษี ในบริบทของระบบอุดมศึกษาและระบบวิทยาศาสตร์ วิจัยและนวัตกรรม (อววน.) ของประเทศ กองทุนมีจุดยืนที่ชัดเจนในการทำหน้าที่เป็น
- กลไกเร่งการเปลี่ยนผ่านเชิงโครงสร้าง ของสถาบันอุดมศึกษา จากระบบที่เน้นปริมาณไปสู่ระบบที่เน้นคุณภาพ ผลลัพธ์ และความเชื่อมโยงกับเศรษฐกิจและสังคม
- ผู้ประสานและเชื่อมโยงทรัพยากร ระหว่างสถาบันอุดมศึกษา หน่วยงานให้ทุนวิจัย ภาคเอกชน และภาคประชาสังคม เพื่อให้เงินลงทุนด้านการศึกษาและวิจัยของประเทศถูกใช้ไปในทิศทางเดียวกันและเสริมพลังซึ่งกันและกัน
- ศูนย์กลางการเรียนรู้และถ่ายทอดบทเรียนเชิงนโยบาย จากโครงการที่ได้รับการสนับสนุน เพื่อขยายผลแนวปฏิบัติที่ดี (good practices) ไปยังสถาบันอุดมศึกษาและพื้นที่อื่น ๆ